ID   Q6AVI0_ORYSJ            Unreviewed;       722 AA.
AC   Q6AVI0;
DT   13-SEP-2004, integrated into UniProtKB/TrEMBL.
DT   13-SEP-2004, sequence version 1.
DT   01-MAY-2013, entry version 60.
DE   SubName: Full=HAT family dimerisation domain containing protein, expressed;
DE   SubName: Full=Os03g0733400 protein;
DE   SubName: Full=Putative hAT family dimerisation domain containing protein;
DE   SubName: Full=Putative transposases;
DE   SubName: Full=cDNA clone:J023075B19, full insert sequence;
GN   Name=OSJNBa0079G12.4; Synonyms=Os03g0733400, OSJNBa0027J18.23;
GN   OrderedLocusNames=LOC_Os03g52310; ORFNames=OsJ_12466;
OS   Oryza sativa subsp. japonica (Rice).
OC   Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
OC   Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade;
OC   Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
OX   NCBI_TaxID=39947;
RN   [1]
RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RA   Buell C.R., Yuan Q., Ouyang S., Liu J., Gansberger K., Jones K.M.,
RA   Overton II L.L., Tsitrin T., Kim M.M., Bera J.J., Jin S.S.,
RA   Fadrosh D.W., Tallon L.J., Koo H., Zismann V., Hsiao J., Blunt S.,
RA   Vanaken S.S., Riedmuller S.B., Utterback T.T., Feldblyum T.V.,
RA   Yang Q.Q., Haas B.J., Suh B.B., Peterson J.J., Quackenbush J.,
RA   White O., Salzberg S.L., Fraser C.M.;
RT   "Oryza sativa chromosome 3 BAC OSJNBa0027J18 genomic sequence.";
RL   Submitted (SEP-2001) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
RN   [2]
RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RA   Buell C.R., Yuan Q., Ouyang S., Liu J., Gansberger K., Jones K.M.,
RA   Overton II L.L., Tsitrin T., Kim M.M., Bera J.J., Jin S.S.,
RA   Fadrosh D.W., Tallon L.J., Koo H., Zismann V., Hsiao J., Blunt S.,
RA   Vanaken S.S., Riedmuller S.B., Utterback T.T., Feldblyum T.V.,
RA   Yang Q.Q., Haas B.J., Suh B.B., Peterson J.J., Quackenbush J.,
RA   White O., Salzberg S.L., Fraser C.M.;
RT   "Oryza sativa chromosome 3 BAC OSJNBa0079G12 genomic sequence.";
RL   Submitted (NOV-2001) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
RN   [3]
RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RA   Kikuchi S., Satoh K., Nagata T., Kawagashira N., Doi K., Kishimoto N.,
RA   Yazaki J., Ishikawa M., Yamada H., Ooka H., Hotta I., Kojima K.,
RA   Namiki T., Ohneda E., Yahagi W., Suzuki K., Li C., Ohtsuki K.,
RA   Shishiki T., Otomo Y., Murakami K., Iida Y., Sugano S., Fujimura T.,
RA   Suzuki Y., Tsunoda Y., Kurosaki T., Kodama T., Masuda H.,
RA   Kobayashi M., Xie Q., Lu M., Narikawa R., Sugiyama A., Mizuno K.,
RA   Yokomizo S., Niikura J., Ikeda R., Ishibiki J., Kawamata M.,
RA   Yoshimura A., Miura J., Kusumegi T., Oka M., Ryu R., Ueda M.,
RA   Matsubara K., Kawai J., Carninci P., Adachi J., Aizawa K., Arakawa T.,
RA   Fukuda S., Hara A., Hashidume W., Hayatsu N., Imotani K., Ishii Y.,
RA   Itoh M., Kagawa I., Kondo S., Konno H., Miyazaki A., Osato N., Ota Y.,
RA   Saito R., Sasaki D., Sato K., Shibata K., Shinagawa A., Shiraki T.,
RA   Yoshino M., Hayashizaki Y.;
RT   "Collection, Mapping, and Annotation of Over 28,000 cDNA Clones from
RT   japonica Rice.";
RL   Science 301:376-379(2003).
RN   [4]
RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RA   Adachi J., Aizawa K., Akimura T., Arakawa T., Carninci P., Doi K.,
RA   Fujimura T., Fukuda S., Hanagaki T., Hara A., Hashizume W.,
RA   Hayashida K., Hayashizaki Y., Hayatsu N., Hiramoto K., Hiraoka T.,
RA   Hori F., Hotta I., Iida J., Iida Y., Ikeda R., Imamura K., Imotani K.,
RA   Ishibiki J., Ishii Y., Ishikawa M., Itoh M., Kagawa I., Kanagawa S.,
RA   Katoh H., Kawagashira N., Kawai J., Kawamata M., Kikuchi S.,
RA   Kishikawa-Hirozane T., Kishimoto N., Kobayashi M., Kodama T.,
RA   Kojima K., Kojima Y., Kondo S., Konno H., Kouda M., Koya S.,
RA   Kurihara C., Kurosaki T., Kusumegi T., Li C., Lu M., Masuda H.,
RA   Matsubara K., Matsuyama T., Miura J., Miyazaki A., Mizuno K.,
RA   Murakami K., Murata M., Nagata T., Nakahama Y., Nakamura M.,
RA   Namiki T., Narikawa R., Niikura J., Nishi K., Nomura K., Numasaki R.,
RA   Ohneda E., Ohno M., Ohtsuki K., Oka M., Ooka H., Osato N., Ota Y.,
RA   Otomo Y., Ryu R., Saitoh H., Sakai C., Sakai K., Sakazume N., Sano H.,
RA   Sasaki D., Sato K., Satoh K., Shibata K., Shinagawa A., Shiraki T.,
RA   Shishiki T., Sogabe Y., Sugano S., Sugiyama A., Suzuki K., Suzuki Y.,
RA   Tagami M., Tagami-Takeda Y., Tagawa A., Takahashi F.,
RA   Takaku-Akahira S., Tanaka T., Tomaru A., Toya T., Tsunoda Y., Ueda M.,
RA   Waki K., Xie Q., Yahagi W., Yamada H., Yamamoto M., Yasunishi A.,
RA   Yazaki J., Yokomizo S., Yoshimura A.;
RT   "Collection, mapping, and annotation of 28K full-length cDNA clones
RT   from japonica rice.";
RL   Submitted (JAN-2003) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
RN   [5]
RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RA   Buell R.;
RL   Submitted (JUL-2004) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
RN   [6]
RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA].
RC   STRAIN=cv. Nipponbare;
RX   PubMed=16109971; DOI=10.1101/gr.3869505;
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RA   Buell C.R., Yuan Q., Ouyang S., Liu J., Zhu W., Wang A., Maiti R.,
RA   Haas B., Wortman J., Pertea M., Jones K.M., Kim M., Overton L.,
RA   Tsitrin T., Fadrosh D., Bera J., Weaver B., Jin S., Johri S.,
RA   Reardon M., Webb K., Hill J., Moffat K., Tallon L., Van Aken S.,
RA   Lewis M., Utterback T., Feldblyum T., Zismann V., Iobst S., Hsiao J.,
RA   de Vazeille A.R., Salzberg S.L., White O., Fraser C.M., Yu Y., Kim H.,
RA   Rambo T., Currie J., Collura K., Kernodle-Thompson S., Wei F.,
RA   Kudrna K., Ammiraju J.S.S., Luo M., Goicoechea J.L., Wing R.A.,
RA   Henry D., Oates R., Palmer M., Pries G., Saski C., Simmons J.,
RA   Soderlund C., Nelson W., de la Bastide M., Spiegel L., Nascimento L.,
RA   Huang E., Preston R., Zutavern T., Palmer L., O'Shaughnessy A.,
RA   Dike S., McCombie W.R., Minx P., Cordum H., Wilson R., Jin W.,
RA   Lee H.R., Jiang J., Jackson S.;
RT   "Sequence, annotation, and analysis of synteny between rice chromosome
RT   3 and diverged grass species.";
RL   Genome Res. 15:1284-1291(2005).
RN   [7]
RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RG   International Rice Genome Sequencing Project;
RA   Matsumoto T., Wu J., Kanamori H., Katayose Y., Fujisawa M., Namiki N.,
RA   Mizuno H., Yamamoto K., Antonio B.A., Baba T., Sakata K., Nagamura Y.,
RA   Aoki H., Arikawa K., Arita K., Bito T., Chiden Y., Fujitsuka N.,
RA   Fukunaka R., Hamada M., Harada C., Hayashi A., Hijishita S., Honda M.,
RA   Hosokawa S., Ichikawa Y., Idonuma A., Iijima M., Ikeda M., Ikeno M.,
RA   Ito K., Ito S., Ito T., Ito Y., Ito Y., Iwabuchi A., Kamiya K.,
RA   Karasawa W., Kurita K., Katagiri S., Kikuta A., Kobayashi H.,
RA   Kobayashi N., Machita K., Maehara T., Masukawa M., Mizubayashi T.,
RA   Mukai Y., Nagasaki H., Nagata Y., Naito S., Nakashima M., Nakama Y.,
RA   Nakamichi Y., Nakamura M., Meguro A., Negishi M., Ohta I., Ohta T.,
RA   Okamoto M., Ono N., Saji S., Sakaguchi M., Sakai K., Shibata M.,
RA   Shimokawa T., Song J., Takazaki Y., Terasawa K., Tsugane M., Tsuji K.,
RA   Ueda S., Waki K., Yamagata H., Yamamoto M., Yamamoto S., Yamane H.,
RA   Yoshiki S., Yoshihara R., Yukawa K., Zhong H., Yano M., Yuan Q.,
RA   Ouyang S., Liu J., Jones K.M., Gansberger K., Moffat K., Hill J.,
RA   Bera J., Fadrosh D., Jin S., Johri S., Kim M., Overton L., Reardon M.,
RA   Tsitrin T., Vuong H., Weaver B., Ciecko A., Tallon L., Jackson J.,
RA   Pai G., Aken S.V., Utterback T., Reidmuller S., Feldblyum T.,
RA   Hsiao J., Zismann V., Iobst S., de Vazeille A.R., Buell C.R., Ying K.,
RA   Li Y., Lu T., Huang Y., Zhao Q., Feng Q., Zhang L., Zhu J., Weng Q.,
RA   Mu J., Lu Y., Fan D., Liu Y., Guan J., Zhang Y., Yu S., Liu X.,
RA   Zhang Y., Hong G., Han B., Choisne N., Demange N., Orjeda G.,
RA   Samain S., Cattolico L., Pelletier E., Couloux A., Segurens B.,
RA   Wincker P., D'Hont A., Scarpelli C., Weissenbach J., Salanoubat M.,
RA   Quetier F., Yu Y., Kim H.R., Rambo T., Currie J., Collura K., Luo M.,
RA   Yang T., Ammiraju J.S.S., Engler F., Soderlund C., Wing R.A.,
RA   Palmer L.E., de la Bastide M., Spiegel L., Nascimento L., Zutavern T.,
RA   O'Shaughnessy A., Dike S., Dedhia N., Preston R., Balija V.,
RA   McCombie W.R., Chow T., Chen H., Chung M., Chen C., Shaw J., Wu H.,
RA   Hsiao K., Chao Y., Chu M., Cheng C., Hour A., Lee P., Lin S., Lin Y.,
RA   Liou J., Liu S., Hsing Y., Raghuvanshi S., Mohanty A., Bharti A.K.,
RA   Gaur A., Gupta V., Kumar D., Ravi V., Vij S., Kapur A., Khurana P.,
RA   Khurana P., Khurana J.P., Tyagi A.K., Gaikwad K., Singh A., Dalal V.,
RA   Srivastava S., Dixit A., Pal A.K., Ghazi I.A., Yadav M., Pandit A.,
RA   Bhargava A., Sureshbabu K., Batra K., Sharma T.R., Mohapatra T.,
RA   Singh N.K., Messing J., Nelson A.B., Fuks G., Kavchok S., Keizer G.,
RA   Linton E., Llaca V., Song R., Tanyolac B., Young S., Ho-Il K.,
RA   Hahn J.H., Sangsakoo G., Vanavichit A., de Mattos Luiz.A.T.,
RA   Zimmer P.D., Malone G., Dellagostin O., de Oliveira A.C., Bevan M.,
RA   Bancroft I., Minx P., Cordum H., Wilson R., Cheng Z., Jin W.,
RA   Jiang J., Leong S.A., Iwama H., Gojobori T., Itoh T., Niimura Y.,
RA   Fujii Y., Habara T., Sakai H., Sato Y., Wilson G., Kumar K.,
RA   McCouch S., Juretic N., Hoen D., Wright S., Bruskiewich R., Bureau T.,
RA   Miyao A., Hirochika H., Nishikawa T., Kadowaki K., Sugiura M.,
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RC   STRAIN=cv. Nipponbare;
RX   PubMed=16100779; DOI=10.1038/nature03895;
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RT   "The map-based sequence of the rice genome.";
RL   Nature 436:793-800(2005).
RN   [9]
RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA].
RC   STRAIN=cv. Nipponbare;
RX   PubMed=15685292; DOI=10.1371/journal.pbio.0030038;
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RA   Zeng C., Zhang J., Zhang Y., Li R., Xu Z., Li S., Li X., Zheng H.,
RA   Cong L., Lin L., Yin J., Geng J., Li G., Shi J., Liu J., Lv H., Li J.,
RA   Wang J., Deng Y., Ran L., Shi X., Wang X., Wu Q., Li C., Ren X.,
RA   Wang J., Wang X., Li D., Liu D., Zhang X., Ji Z., Zhao W., Sun Y.,
RA   Zhang Z., Bao J., Han Y., Dong L., Ji J., Chen P., Wu S., Liu J.,
RA   Xiao Y., Bu D., Tan J., Yang L., Ye C., Zhang J., Xu J., Zhou Y.,
RA   Yu Y., Zhang B., Zhuang S., Wei H., Liu B., Lei M., Yu H., Li Y.,
RA   Xu H., Wei S., He X., Fang L., Zhang Z., Zhang Y., Huang X., Su Z.,
RA   Tong W., Li J., Tong Z., Li S., Ye J., Wang L., Fang L., Lei T.,
RA   Chen C., Chen H., Xu Z., Li H., Huang H., Zhang F., Xu H., Li N.,
RA   Zhao C., Li S., Dong L., Huang Y., Li L., Xi Y., Qi Q., Li W.,
RA   Zhang B., Hu W., Zhang Y., Tian X., Jiao Y., Liang X., Jin J., Gao L.,
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RL   Submitted (FEB-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
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RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE.
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RL   Submitted (FEB-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
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RT   "The Rice Annotation Project Database (RAP-DB): hub for Oryza sativa
RT   ssp. japonica genome information.";
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RN   [13]
RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RA   Buell R., Wing R.A., McCombie W.A., Ouyang S.;
RL   Submitted (JUN-2006) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
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RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RA   Wang J., Li R., Fan W., Huang Q., Zhang J., Zhou Y., Hu Y., Zi S.,
RA   Li J., Ni P., Zheng H., Zhang Y., Zhao M., Hao Q., McDermott J.,
RA   Samudrala R., Kristiansen K., Wong G.K.-S.;
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RL   Submitted (SEP-2006) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
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RA   Itoh T., Tanaka T., Barrero R.A., Yamasaki C., Fujii Y., Hilton P.B.,
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RA   Kikuchi S., Komatsu S., Koyanagi K.O., Kubooka H., Lieberherr D.,
RA   Lin Y.C., Lonsdale D., Matsumoto T., Matsuya A., McCombie W.R.,
RA   Messing J., Miyao A., Mulder N., Nagamura Y., Nam J., Namiki N.,
RA   Numa H., Nurimoto S., O'donovan C., Ohyanagi H., Okido T., Oota S.,
RA   Osato N., Palmer L.E., Quetier F., Raghuvanshi S., Saichi N.,
RA   Sakai H., Sakai Y., Sakata K., Sakurai T., Sato F., Sato Y.,
RA   Schoof H., Seki M., Shibata M., Shimizu Y., Shinozaki K., Shinso Y.,
RA   Singh N.K., Smith-White B., Takeda J., Tanino M., Tatusova T.,
RA   Thongjuea S., Todokoro F., Tsugane M., Tyagi A.K., Vanavichit A.,
RA   Wang A., Wing R.A., Yamaguchi K., Yamamoto M., Yamamoto N., Yu Y.,
RA   Zhang H., Zhao Q., Higo K., Burr B., Gojobori T., Sasaki T.;
RT   "Curated Genome Annotation of Oryza sativa ssp. japonica and
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RL   Genome Res. 17:175-183(2007).
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RX   PubMed=18089549; DOI=10.1093/nar/gkm978;
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RL   Nucleic Acids Res. 36:D1028-D1033(2008).
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RG   The Rice Annotation Project (RAP);
RA   Tanaka T., Antonio B.A., Kikuchi S., Matsumoto T., Nagamura Y.,
RA   Numa H., Sakai H., Wu J., Itoh T., Sasaki T., Aono R., Fujii Y.,
RA   Habara T., Harada E., Kanno M., Kawahara Y., Kawashima H., Kubooka H.,
RA   Matsuya A., Nakaoka H., Saichi N., Sanbonmatsu R., Sato Y., Shinso Y.,
RA   Suzuki M., Takeda J., Tanino M., Todokoro F., Yamaguchi K.,
RA   Yamamoto N., Yamasaki C., Imanishi T., Okido T., Tada M., Ikeo K.,
RA   Tateno Y., Gojobori T., Lin Y.C., Wei F.J., Hsing Y.I., Zhao Q.,
RA   Han B., Kramer M.R., McCombie R.W., Lonsdale D., O'Donovan C.C.,
RA   Whitfield E.J., Apweiler R., Koyanagi K.O., Khurana J.P.,
RA   Raghuvanshi S., Singh N.K., Tyagi A.K., Haberer G., Fujisawa M.,
RA   Hosokawa S., Ito Y., Ikawa H., Shibata M., Yamamoto M.,
RA   Bruskiewich R.M., Hoen D.R., Bureau TE., Namiki N., Ohyanagi H.,
RA   Sakai Y., Nobushima S., Sakata K., Barrero R.A., Sato Y., Souvorov A.,
RA   Smith-White B., Tatusova T., An S., An G., OOta S., Fuks G.,
RA   Messing J., Christie K.R., Lieberherr D., Kim H., Zuccolo A.,
RA   Wing R.A., Nobuta K., Green P.J., Lu C., Meyers BC., Chaparro C.,
RA   Piegu B., Panaud O., Echeverria M.;
RT   "The Rice Annotation Project Database (RAP-DB): 2008 update.";
RL   Nucleic Acids Res. 36:D1028-D1033(2008).
RN   [18]
RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RA   Wang J., Li R., Fan W., Huang Q., Zhang J., Zhou Y., Hu Y., Zi S.,
RA   Li J., Ni P., Zheng H., Zhang Y., Zhao M., Hao Q., McDermott J.,
RA   Samudrala R., Kristiansen K., Wong G.K.-S.;
RL   Submitted (DEC-2008) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
CC   ---------------------------------------------------------------------------
CC   Copyrighted by the UniProt Consortium, see https://www.uniprot.org/terms
CC   Distributed under the Creative Commons Attribution (CC BY 4.0) License
CC   ---------------------------------------------------------------------------
DR   EMBL; AC103550; AAT77879.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AC096689; AAT78789.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; DP000009; ABF98716.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP008209; BAF13087.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AK121128; BAH00332.1; -; mRNA.
DR   EMBL; CM000140; EAZ28483.1; -; Genomic_DNA.
DR   RefSeq; NP_001051173.1; NM_001057708.1.
DR   UniGene; Os.80780; -.
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DR   GO; GO:0003677; F:DNA binding; IEA:InterPro.
DR   GO; GO:0009791; P:post-embryonic development; IEA:EnsemblPlants/Gramene.
DR   InterPro; IPR025525; DUF4413.
DR   InterPro; IPR008906; HATC.
DR   InterPro; IPR012337; RNaseH-like_dom.
DR   InterPro; IPR003656; Znf_BED_prd.
DR   Pfam; PF05699; Dimer_Tnp_hAT; 1.
DR   Pfam; PF14372; DUF4413; 1.
DR   Pfam; PF02892; zf-BED; 1.
DR   SMART; SM00614; ZnF_BED; 1.
DR   SUPFAM; SSF53098; RNaseH_fold; 1.
DR   PROSITE; PS50808; ZF_BED; 1.
PE   2: Evidence at transcript level;
KW   Complete proteome; Reference proteome.
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     FDMYLSEIAT SQPTKSELEQ YLDESLTPRI QEFDILNWWK LNTLKFPTLS RMARDILAIP
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     AP
//