ID Q6AVI0_ORYSJ Unreviewed; 722 AA. AC Q6AVI0; DT 13-SEP-2004, integrated into UniProtKB/TrEMBL. DT 13-SEP-2004, sequence version 1. DT 03-MAY-2011, entry version 42. DE SubName: Full=HAT family dimerisation domain containing protein, expressed; DE SubName: Full=Os03g0733400 protein; DE SubName: Full=Putative hAT family dimerisation domain containing protein; DE SubName: Full=Putative transposases; DE SubName: Full=Putative uncharacterized protein; DE SubName: Full=cDNA clone:J023075B19, full insert sequence; GN Name=OSJNBa0079G12.4; Synonyms=OSJNBa0027J18.23, Os03g0733400; GN ORFNames=LOC_Os03g52310, OsJ_12466; OS Oryza sativa subsp. japonica (Rice). OC Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; OC Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; OC Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza. OX NCBI_TaxID=39947; RN [1] RP NUCLEOTIDE SEQUENCE. RA Buell C.R., Yuan Q., Ouyang S., Liu J., Gansberger K., Jones K.M., RA Overton II L.L., Tsitrin T., Kim M.M., Bera J.J., Jin S.S., RA Fadrosh D.W., Tallon L.J., Koo H., Zismann V., Hsiao J., Blunt S., RA Vanaken S.S., Riedmuller S.B., Utterback T.T., Feldblyum T.V., RA Yang Q.Q., Haas B.J., Suh B.B., Peterson J.J., Quackenbush J., RA White O., Salzberg S.L., Fraser C.M.; RT "Oryza sativa chromosome 3 BAC OSJNBa0079G12 genomic sequence."; RL Submitted (NOV-2001) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. RN [2] RP NUCLEOTIDE SEQUENCE. RA Buell R.; RL Submitted (JUL-2004) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. RN [3] RP NUCLEOTIDE SEQUENCE. RX PubMed=15685292; DOI=10.1371/journal.pbio.0030038; RA Yu J., Wang J., Lin W., Li S., Li H., Zhou J., Ni P., Dong W., Hu S., RA Zeng C., Zhang J., Zhang Y., Li R., Xu Z., Li S., Li X., Zheng H., RA Cong L., Lin L., Yin J., Geng J., Li G., Shi J., Liu J., Lv H., Li J., RA Wang J., Deng Y., Ran L., Shi X., Wang X., Wu Q., Li C., Ren X., RA Wang J., Wang X., Li D., Liu D., Zhang X., Ji Z., Zhao W., Sun Y., RA Zhang Z., Bao J., Han Y., Dong L., Ji J., Chen P., Wu S., Liu J., RA Xiao Y., Bu D., Tan J., Yang L., Ye C., Zhang J., Xu J., Zhou Y., RA Yu Y., Zhang B., Zhuang S., Wei H., Liu B., Lei M., Yu H., Li Y., RA Xu H., Wei S., He X., Fang L., Zhang Z., Zhang Y., Huang X., Su Z., RA Tong W., Li J., Tong Z., Li S., Ye J., Wang L., Fang L., Lei T., RA Chen C.-S., Chen H.-C., Xu Z., Li H., Huang H., Zhang F., Xu H., RA Li N., Zhao C., Li S., Dong L., Huang Y., Li L., Xi Y., Qi Q., Li W., RA Zhang B., Hu W., Zhang Y., Tian X., Jiao Y., Liang X., Jin J., Gao L., RA Zheng W., Hao B., Liu S.-M., Wang W., Yuan L., Cao M., McDermott J., RA Samudrala R., Wang J., Wong G.K.-S., Yang H.; RT "The genomes of Oryza sativa: a history of duplications."; RL PLoS Biol. 3:266-281(2005). RN [4] RP NUCLEOTIDE SEQUENCE. RA Wang J., Li R., Fan W., Huang Q., Zhang J., Zhou Y., Hu Y., Zi S., RA Li J., Ni P., Zheng H., Zhang Y., Zhao M., Hao Q., McDermott J., RA Samudrala R., Kristiansen K., Wong G.K.-S.; RT "Improved gene annotation of the rice (Oryza sativa) genomes."; RL Submitted (SEP-2006) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. RN [5] RP NUCLEOTIDE SEQUENCE. RA Wang J., Li R., Fan W., Huang Q., Zhang J., Zhou Y., Hu Y., Zi S., RA Li J., Ni P., Zheng H., Zhang Y., Zhao M., Hao Q., McDermott J., RA Samudrala R., Kristiansen K., Wong G.K.-S.; RL Submitted (DEC-2008) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. RN [6] RP NUCLEOTIDE SEQUENCE. RA Kikuchi S., Satoh K., Nagata T., Kawagashira N., Doi K., Kishimoto N., RA Yazaki J., Ishikawa M., Yamada H., Ooka H., Hotta I., Kojima K., RA Namiki T., Ohneda E., Yahagi W., Suzuki K., Li C., Ohtsuki K., RA Shishiki T., Otomo Y., Murakami K., Iida Y., Sugano S., Fujimura T., RA Suzuki Y., Tsunoda Y., Kurosaki T., Kodama T., Masuda H., RA Kobayashi M., Xie Q., Lu M., Narikawa R., Sugiyama A., Mizuno K., RA Yokomizo S., Niikura J., Ikeda R., Ishibiki J., Kawamata M., RA Yoshimura A., Miura J., Kusumegi T., Oka M., Ryu R., Ueda M., RA Matsubara K., Kawai J., Carninci P., Adachi J., Aizawa K., Arakawa T., RA Fukuda S., Hara A., Hashidume W., Hayatsu N., Imotani K., Ishii Y., RA Itoh M., Kagawa I., Kondo S., Konno H., Miyazaki A., Osato N., Ota Y., RA Saito R., Sasaki D., Sato K., Shibata K., Shinagawa A., Shiraki T., RA Yoshino M., Hayashizaki Y.; RT "Collection, Mapping, and Annotation of Over 28,000 cDNA Clones from RT japonica Rice."; RL Science 301:376-379(2003). RN [7] RP NUCLEOTIDE SEQUENCE. RA Adachi J., Aizawa K., Akimura T., Arakawa T., Carninci P., Doi K., RA Fujimura T., Fukuda S., Hanagaki T., Hara A., Hashizume W., RA Hayashida K., Hayashizaki Y., Hayatsu N., Hiramoto K., Hiraoka T., RA Hori F., Hotta I., Iida J., Iida Y., Ikeda R., Imamura K., Imotani K., RA Ishibiki J., Ishii Y., Ishikawa M., Itoh M., Kagawa I., Kanagawa S., RA Katoh H., Kawagashira N., Kawai J., Kawamata M., Kikuchi S., RA Kishikawa-Hirozane T., Kishimoto N., Kobayashi M., Kodama T., RA Kojima K., Kojima Y., Kondo S., Konno H., Kouda M., Koya S., RA Kurihara C., Kurosaki T., Kusumegi T., Li C., Lu M., Masuda H., RA Matsubara K., Matsuyama T., Miura J., Miyazaki A., Mizuno K., RA Murakami K., Murata M., Nagata T., Nakahama Y., Nakamura M., RA Namiki T., Narikawa R., Niikura J., Nishi K., Nomura K., Numasaki R., RA Ohneda E., Ohno M., Ohtsuki K., Oka M., Ooka H., Osato N., Ota Y., RA Otomo Y., Ryu R., Saitoh H., Sakai C., Sakai K., Sakazume N., Sano H., RA Sasaki D., Sato K., Satoh K., Shibata K., Shinagawa A., Shiraki T., RA Shishiki T., Sogabe Y., Sugano S., Sugiyama A., Suzuki K., Suzuki Y., RA Tagami M., Tagami-Takeda Y., Tagawa A., Takahashi F., RA Takaku-Akahira S., Tanaka T., Tomaru A., Toya T., Tsunoda Y., Ueda M., RA Waki K., Xie Q., Yahagi W., Yamada H., Yamamoto M., Yasunishi A., RA Yazaki J., Yokomizo S., Yoshimura A.; RT "Collection, mapping, and annotation of 28K full-length cDNA clones RT from japonica rice."; RL Submitted (JAN-2003) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. RN [8] RP NUCLEOTIDE SEQUENCE. RG International Rice Genome Sequencing Project; RA Matsumoto T., Wu J., Kanamori H., Katayose Y., Fujisawa M., Namiki N., RA Mizuno H., Yamamoto K., Antonio B.A., Baba T., Sakata K., Nagamura Y., RA Aoki H., Arikawa K., Arita K., Bito T., Chiden Y., Fujitsuka N., RA Fukunaka R., Hamada M., Harada C., Hayashi A., Hijishita S., Honda M., RA Hosokawa S., Ichikawa Y., Idonuma A., Iijima M., Ikeda M., Ikeno M., RA Ito K., Ito S., Ito T., Ito Y., Ito Y., Iwabuchi A., Kamiya K., RA Karasawa W., Kurita K., Katagiri S., Kikuta A., Kobayashi H., RA Kobayashi N., Machita K., Maehara T., Masukawa M., Mizubayashi T., RA Mukai Y., Nagasaki H., Nagata Y., Naito S., Nakashima M., Nakama Y., RA Nakamichi Y., Nakamura M., Meguro A., Negishi M., Ohta I., Ohta T., RA Okamoto M., Ono N., Saji S., Sakaguchi M., Sakai K., Shibata M., RA Shimokawa T., Song J., Takazaki Y., Terasawa K., Tsugane M., Tsuji K., RA Ueda S., Waki K., Yamagata H., Yamamoto M., Yamamoto S., Yamane H., RA Yoshiki S., Yoshihara R., Yukawa K., Zhong H., Yano M., Yuan Q., RA Ouyang S., Liu J., Jones K.M., Gansberger K., Moffat K., Hill J., RA Bera J., Fadrosh D., Jin S., Johri S., Kim M., Overton L., Reardon M., RA Tsitrin T., Vuong H., Weaver B., Ciecko A., Tallon L., Jackson J., RA Pai G., Aken S.V., Utterback T., Reidmuller S., Feldblyum T., RA Hsiao J., Zismann V., Iobst S., de Vazeille A.R., Buell C.R., Ying K., RA Li Y., Lu T., Huang Y., Zhao Q., Feng Q., Zhang L., Zhu J., Weng Q., RA Mu J., Lu Y., Fan D., Liu Y., Guan J., Zhang Y., Yu S., Liu X., RA Zhang Y., Hong G., Han B., Choisne N., Demange N., Orjeda G., RA Samain S., Cattolico L., Pelletier E., Couloux A., Segurens B., RA Wincker P., D'Hont A., Scarpelli C., Weissenbach J., Salanoubat M., RA Quetier F., Yu Y., Kim H.R., Rambo T., Currie J., Collura K., Luo M., RA Yang T., Ammiraju J.S.S., Engler F., Soderlund C., Wing R.A., RA Palmer L.E., de la Bastide M., Spiegel L., Nascimento L., Zutavern T., RA O'Shaughnessy A., Dike S., Dedhia N., Preston R., Balija V., RA McCombie W.R., Chow T., Chen H., Chung M., Chen C., Shaw J., Wu H., RA Hsiao K., Chao Y., Chu M., Cheng C., Hour A., Lee P., Lin S., Lin Y., RA Liou J., Liu S., Hsing Y., Raghuvanshi S., Mohanty A., Bharti A.K., RA Gaur A., Gupta V., Kumar D., Ravi V., Vij S., Kapur A., Khurana P., RA Khurana P., Khurana J.P., Tyagi A.K., Gaikwad K., Singh A., Dalal V., RA Srivastava S., Dixit A., Pal A.K., Ghazi I.A., Yadav M., Pandit A., RA Bhargava A., Sureshbabu K., Batra K., Sharma T.R., Mohapatra T., RA Singh N.K., Messing J., Nelson A.B., Fuks G., Kavchok S., Keizer G., RA Linton E., Llaca V., Song R., Tanyolac B., Young S., Ho-Il K., RA Hahn J.H., Sangsakoo G., Vanavichit A., de Mattos Luiz.A.T., RA Zimmer P.D., Malone G., Dellagostin O., de Oliveira A.C., Bevan M., RA Bancroft I., Minx P., Cordum H., Wilson R., Cheng Z., Jin W., RA Jiang J., Leong S.A., Iwama H., Gojobori T., Itoh T., Niimura Y., RA Fujii Y., Habara T., Sakai H., Sato Y., Wilson G., Kumar K., RA McCouch S., Juretic N., Hoen D., Wright S., Bruskiewich R., Bureau T., RA Miyao A., Hirochika H., Nishikawa T., Kadowaki K., Sugiura M., RA Burr B., Sasaki T.; RT "The map-based sequence of the rice genome."; RL Nature 436:793-800(2005). RN [9] RP NUCLEOTIDE SEQUENCE. RX PubMed=16381971; DOI=10.1093/nar/gkj094; RA Ohyanagi H., Tanaka T., Sakai H., Shigemoto Y., Yamaguchi K., RA Habara T., Fujii Y., Antonio B.A., Nagamura Y., Imanishi T., Ikeo K., RA Itoh T., Gojobori T., Sasaki T.; RT "The Rice Annotation Project Database (RAP-DB): hub for Oryza sativa RT ssp. japonica genome information."; RL Nucleic Acids Res. 34:D741-D744(2006). RN [10] RP NUCLEOTIDE SEQUENCE. RG The Rice Annotation Project (RAP); RA Itoh T., Tanaka T., Barrero R.A., Yamasaki C., Fujii Y., Hilton P.B., RA Antonio B.A., Aono H., Apweiler R., Bruskiewich R., Bureau T., RA Burr F., Costa de Oliveira A., Fuks G., Habara T., Haberer G., Han B., RA Harada E., Hiraki A.T., Hirochika H., Hoen D., Hokari H., Hosokawa S., RA Hsing Y., Ikawa H., Ikeo K., Imanishi T., Ito Y., Jaiswal P., RA Kanno M., Kawahara Y., Kawamura T., Kawashima H., Khurana J.P., RA Kikuchi S., Komatsu S., Koyanagi K.O., Kubooka H., Lieberherr D., RA Lin Y.C., Lonsdale D., Matsumoto T., Matsuya A., McCombie W.R., RA Messing J., Miyao A., Mulder N., Nagamura Y., Nam J., Namiki N., RA Numa H., Nurimoto S., O'donovan C., Ohyanagi H., Okido T., Oota S., RA Osato N., Palmer L.E., Quetier F., Raghuvanshi S., Saichi N., RA Sakai H., Sakai Y., Sakata K., Sakurai T., Sato F., Sato Y., RA Schoof H., Seki M., Shibata M., Shimizu Y., Shinozaki K., Shinso Y., RA Singh N.K., Smith-White B., Takeda J., Tanino M., Tatusova T., RA Thongjuea S., Todokoro F., Tsugane M., Tyagi A.K., Vanavichit A., RA Wang A., Wing R.A., Yamaguchi K., Yamamoto M., Yamamoto N., Yu Y., RA Zhang H., Zhao Q., Higo K., Burr B., Gojobori T., Sasaki T.; RT "Curated Genome Annotation of Oryza sativa ssp. japonica and RT Comparative Genome Analysis with Arabidopsis thaliana."; RL Genome Res. 17:175-183(2007). RN [11] RP NUCLEOTIDE SEQUENCE. RG The Rice Annotation Project (RAP); RA Tanaka T., Antonio B.A., Kikuchi S., Matsumoto T., Nagamura Y., RA Numa H., Sakai H., Wu J., Itoh T., Sasaki T., Aono R., Fujii Y., RA Habara T., Harada E., Kanno M., Kawahara Y., Kawashima H., Kubooka H., RA Matsuya A., Nakaoka H., Saichi N., Sanbonmatsu R., Sato Y., Shinso Y., RA Suzuki M., Takeda J., Tanino M., Todokoro F., Yamaguchi K., RA Yamamoto N., Yamasaki C., Imanishi T., Okido T., Tada M., Ikeo K., RA Tateno Y., Gojobori T., Lin Y.C., Wei F.J., Hsing Y.I., Zhao Q., RA Han B., Kramer M.R., McCombie R.W., Lonsdale D., O'Donovan C.C., RA Whitfield E.J., Apweiler R., Koyanagi K.O., Khurana J.P., RA Raghuvanshi S., Singh N.K., Tyagi A.K., Haberer G., Fujisawa M., RA Hosokawa S., Ito Y., Ikawa H., Shibata M., Yamamoto M., RA Bruskiewich R.M., Hoen D.R., Bureau TE., Namiki N., Ohyanagi H., RA Sakai Y., Nobushima S., Sakata K., Barrero R.A., Sato Y., Souvorov A., RA Smith-White B., Tatusova T., An S., An G., OOta S., Fuks G., RA Messing J., Christie K.R., Lieberherr D., Kim H., Zuccolo A., RA Wing R.A., Nobuta K., Green P.J., Lu C., Meyers BC., Chaparro C., RA Piegu B., Panaud O., Echeverria M.; RT "The Rice Annotation Project Database (RAP-DB): 2008 update."; RL Nucleic Acids Res. 36:D1028-D1033(2008). 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RX PubMed=16109971; DOI=10.1101/gr.3869505; RG The rice chromosome 3 sequencing consortium; RA Buell C.R., Yuan Q., Ouyang S., Liu J., Zhu W., Wang A., Maiti R., RA Haas B., Wortman J., Pertea M., Jones K.M., Kim M., Overton L., RA Tsitrin T., Fadrosh D., Bera J., Weaver B., Jin S., Johri S., RA Reardon M., Webb K., Hill J., Moffat K., Tallon L., Van Aken S., RA Lewis M., Utterback T., Feldblyum T., Zismann V., Iobst S., Hsiao J., RA de Vazeille A.R., Salzberg S.L., White O., Fraser C.M., Yu Y., Kim H., RA Rambo T., Currie J., Collura K., Kernodle-Thompson S., Wei F., RA Kudrna K., Ammiraju J.S.S., Luo M., Goicoechea J.L., Wing R.A., RA Henry D., Oates R., Palmer M., Pries G., Saski C., Simmons J., RA Soderlund C., Nelson W., de la Bastide M., Spiegel L., Nascimento L., RA Huang E., Preston R., Zutavern T., Palmer L., O'Shaughnessy A., RA Dike S., McCombie W.R., Minx P., Cordum H., Wilson R., Jin W., RA Lee H.R., Jiang J., Jackson S.; RT "Sequence, annotation, and analysis of synteny between rice chromosome RT 3 and diverged grass species."; RL Genome Res. 15:1284-1291(2005). 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CC --------------------------------------------------------------------------- CC Copyrighted by the UniProt Consortium, see https://www.uniprot.org/terms CC Distributed under the Creative Commons Attribution (CC BY 4.0) License CC --------------------------------------------------------------------------- DR EMBL; AC103550; AAT77879.1; -; Genomic_DNA. DR EMBL; AC096689; AAT78789.1; -; Genomic_DNA. DR EMBL; DP000009; ABF98716.1; -; Genomic_DNA. DR EMBL; AP008209; BAF13087.1; -; Genomic_DNA. DR EMBL; AK121128; BAH00332.1; -; mRNA. DR EMBL; CM000140; EAZ28483.1; -; Genomic_DNA. DR RefSeq; NP_001051173.1; NM_001057708.1. DR UniGene; Os.80780; -. DR PRIDE; Q6AVI0; -. DR EnsemblPlants; LOC_Os03g52310.1; LOC_Os03g52310.1; LOC_Os03g52310. DR GeneID; 4334009; -. DR GenomeReviews; AP008209_GR; OSJNBa0079G12.4. DR KEGG; osa:4334009; -. DR Gramene; Q6AVI0; -. DR GeneTree; EPGT00050000001689; -. DR HOGENOM; HBG633580; -. DR ProtClustDB; CLSN2691469; -. 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