ID Q3U8J6_MOUSE Unreviewed; 191 AA. AC Q3U8J6; DT 11-OCT-2005, integrated into UniProtKB/TrEMBL. DT 11-OCT-2005, sequence version 1. DT 10-FEB-2009, entry version 22. DE SubName: Full=Putative uncharacterized protein; DE Flags: Fragment; GN Name=Ctsc; OS Mus musculus (Mouse). OC Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; OC Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Glires; Rodentia; Sciurognathi; OC Muroidea; Muridae; Murinae; Mus. OX NCBI_TaxID=10090; RN [1] RP NUCLEOTIDE SEQUENCE. RC STRAIN=C57BL/6J; TISSUE=Bone marrow; RX MEDLINE=99279253; PubMed=10349636; DOI=10.1016/S0076-6879(99)03004-9; RA Carninci P., Hayashizaki Y.; RT "High-efficiency full-length cDNA cloning."; RL Methods Enzymol. 303:19-44(1999). RN [2] RP NUCLEOTIDE SEQUENCE. RC STRAIN=C57BL/6J; TISSUE=Bone marrow; RX PubMed=16141072; DOI=10.1126/science.1112014; RA Carninci P., Kasukawa T., Katayama S., Gough J., Frith M.C., Maeda N., RA Oyama R., Ravasi T., Lenhard B., Wells C., Kodzius R., Shimokawa K., RA Bajic V.B., Brenner S.E., Batalov S., Forrest A.R., Zavolan M., RA Davis M.J., Wilming L.G., Aidinis V., Allen J.E., RA Ambesi-Impiombato A., Apweiler R., Aturaliya R.N., Bailey T.L., RA Bansal M., Baxter L., Beisel K.W., Bersano T., Bono H., Chalk A.M., RA Chiu K.P., Choudhary V., Christoffels A., Clutterbuck D.R., RA Crowe M.L., Dalla E., Dalrymple B.P., de Bono B., Della Gatta G., RA di Bernardo D., Down T., Engstrom P., Fagiolini M., Faulkner G., RA Fletcher C.F., Fukushima T., Furuno M., Futaki S., Gariboldi M., RA Georgii-Hemming P., Gingeras T.R., Gojobori T., Green R.E., RA Gustincich S., Harbers M., Hayashi Y., Hensch T.K., Hirokawa N., RA Hill D., Huminiecki L., Iacono M., Ikeo K., Iwama A., Ishikawa T., RA Jakt M., Kanapin A., Katoh M., Kawasawa Y., Kelso J., Kitamura H., RA Kitano H., Kollias G., Krishnan S.P., Kruger A., Kummerfeld S.K., RA Kurochkin I.V., Lareau L.F., Lazarevic D., Lipovich L., Liu J., RA Liuni S., McWilliam S., Madan Babu M., Madera M., Marchionni L., RA Matsuda H., Matsuzawa S., Miki H., Mignone F., Miyake S., Morris K., RA Mottagui-Tabar S., Mulder N., Nakano N., Nakauchi H., Ng P., RA Nilsson R., Nishiguchi S., Nishikawa S., Nori F., Ohara O., RA Okazaki Y., Orlando V., Pang K.C., Pavan W.J., Pavesi G., Pesole G., RA Petrovsky N., Piazza S., Reed J., Reid J.F., Ring B.Z., Ringwald M., RA Rost B., Ruan Y., Salzberg S.L., Sandelin A., Schneider C., RA Schoenbach C., Sekiguchi K., Semple C.A., Seno S., Sessa L., Sheng Y., RA Shibata Y., Shimada H., Shimada K., Silva D., Sinclair B., RA Sperling S., Stupka E., Sugiura K., Sultana R., Takenaka Y., Taki K., RA Tammoja K., Tan S.L., Tang S., Taylor M.S., Tegner J., Teichmann S.A., RA Ueda H.R., van Nimwegen E., Verardo R., Wei C.L., Yagi K., RA Yamanishi H., Zabarovsky E., Zhu S., Zimmer A., Hide W., Bult C., RA Grimmond S.M., Teasdale R.D., Liu E.T., Brusic V., Quackenbush J., RA Wahlestedt C., Mattick J.S., Hume D.A., Kai C., Sasaki D., Tomaru Y., RA Fukuda S., Kanamori-Katayama M., Suzuki M., Aoki J., Arakawa T., RA Iida J., Imamura K., Itoh M., Kato T., Kawaji H., Kawagashira N., RA Kawashima T., Kojima M., Kondo S., Konno H., Nakano K., Ninomiya N., RA Nishio T., Okada M., Plessy C., Shibata K., Shiraki T., Suzuki S., RA Tagami M., Waki K., Watahiki A., Okamura-Oho Y., Suzuki H., Kawai J., RA Hayashizaki Y.; RT "The transcriptional landscape of the mammalian genome."; RL Science 309:1559-1563(2005). RN [3] RP NUCLEOTIDE SEQUENCE. RC STRAIN=C57BL/6J; TISSUE=Bone marrow; RX PubMed=16141073; DOI=10.1126/science.1112009; RG RIKEN Genome Exploration Research Group and Genome Science Group RG (Genome Network Project Core Group) and the FANTOM Consortium; RT "Antisense Transcription in the Mammalian Transcriptome."; RL Science 309:1564-1566(2005). RN [4] RP NUCLEOTIDE SEQUENCE. RC STRAIN=C57BL/6J; TISSUE=Bone marrow; RX MEDLINE=22354683; PubMed=12466851; DOI=10.1038/nature01266; RA Okazaki Y., Furuno M., Kasukawa T., Adachi J., Bono H., Kondo S., RA Nikaido I., Osato N., Saito R., Suzuki H., Yamanaka I., Kiyosawa H., RA Yagi K., Tomaru Y., Hasegawa Y., Nogami A., Schonbach C., Gojobori T., RA Baldarelli R., Hill D.P., Bult C., Hume D.A., Quackenbush J., RA Schriml L.M., Kanapin A., Matsuda H., Batalov S., Beisel K.W., RA Blake J.A., Bradt D., Brusic V., Chothia C., Corbani L.E., Cousins S., RA Dalla E., Dragani T.A., Fletcher C.F., Forrest A., Frazer K.S., RA Gaasterland T., Gariboldi M., Gissi C., Godzik A., Gough J., RA Grimmond S., Gustincich S., Hirokawa N., Jackson I.J., Jarvis E.D., RA Kanai A., Kawaji H., Kawasawa Y., Kedzierski R.M., King B.L., RA Konagaya A., Kurochkin I.V., Lee Y., Lenhard B., Lyons P.A., RA Maglott D.R., Maltais L., Marchionni L., McKenzie L., Miki H., RA Nagashima T., Numata K., Okido T., Pavan W.J., Pertea G., Pesole G., RA Petrovsky N., Pillai R., Pontius J.U., Qi D., Ramachandran S., RA Ravasi T., Reed J.C., Reed D.J., Reid J., Ring B.Z., Ringwald M., RA Sandelin A., Schneider C., Semple C.A., Setou M., Shimada K., RA Sultana R., Takenaka Y., Taylor M.S., Teasdale R.D., Tomita M., RA Verardo R., Wagner L., Wahlestedt C., Wang Y., Watanabe Y., Wells C., RA Wilming L.G., Wynshaw-Boris A., Yanagisawa M., Yang I., Yang L., RA Yuan Z., Zavolan M., Zhu Y., Zimmer A., Carninci P., Hayatsu N., RA Hirozane-Kishikawa T., Konno H., Nakamura M., Sakazume N., Sato K., RA Shiraki T., Waki K., Kawai J., Aizawa K., Arakawa T., Fukuda S., RA Hara A., Hashizume W., Imotani K., Ishii Y., Itoh M., Kagawa I., RA Miyazaki A., Sakai K., Sasaki D., Shibata K., Shinagawa A., RA Yasunishi A., Yoshino M., Waterston R., Lander E.S., Rogers J., RA Birney E., Hayashizaki Y.; RT "Analysis of the mouse transcriptome based on functional annotation of RT 60,770 full-length cDNAs."; RL Nature 420:563-573(2002). RN [5] RP NUCLEOTIDE SEQUENCE. RC STRAIN=C57BL/6J; TISSUE=Bone marrow; RX MEDLINE=21085660; PubMed=11217851; DOI=10.1038/35055500; RA Kawai J., Shinagawa A., Shibata K., Yoshino M., Itoh M., Ishii Y., RA Arakawa T., Hara A., Fukunishi Y., Konno H., Adachi J., Fukuda S., RA Aizawa K., Izawa M., Nishi K., Kiyosawa H., Kondo S., Yamanaka I., RA Saito T., Okazaki Y., Gojobori T., Bono H., Kasukawa T., Saito R., RA Kadota K., Matsuda H.A., Ashburner M., Batalov S., Casavant T., RA Fleischmann W., Gaasterland T., Gissi C., King B., Kochiwa H., RA Kuehl P., Lewis S., Matsuo Y., Nikaido I., Pesole G., Quackenbush J., RA Schriml L.M., Staubli F., Suzuki R., Tomita M., Wagner L., Washio T., RA Sakai K., Okido T., Furuno M., Aono H., Baldarelli R., Barsh G., RA Blake J., Boffelli D., Bojunga N., Carninci P., de Bonaldo M.F., RA Brownstein M.J., Bult C., Fletcher C., Fujita M., Gariboldi M., RA Gustincich S., Hill D., Hofmann M., Hume D.A., Kamiya M., Lee N.H., RA Lyons P., Marchionni L., Mashima J., Mazzarelli J., Mombaerts P., RA Nordone P., Ring B., Ringwald M., Rodriguez I., Sakamoto N., RA Sasaki H., Sato K., Schoenbach C., Seya T., Shibata Y., Storch K.-F., RA Suzuki H., Toyo-oka K., Wang K.H., Weitz C., Whittaker C., Wilming L., RA Wynshaw-Boris A., Yoshida K., Hasegawa Y., Kawaji H., Kohtsuki S., RA Hayashizaki Y.; RT "Functional annotation of a full-length mouse cDNA collection."; RL Nature 409:685-690(2001). RN [6] RP NUCLEOTIDE SEQUENCE. RC STRAIN=C57BL/6J; TISSUE=Bone marrow; RX MEDLINE=20499374; PubMed=11042159; DOI=10.1101/gr.145100; RA Carninci P., Shibata Y., Hayatsu N., Sugahara Y., Shibata K., Itoh M., RA Konno H., Okazaki Y., Muramatsu M., Hayashizaki Y.; RT "Normalization and subtraction of cap-trapper-selected cDNAs to RT prepare full-length cDNA libraries for rapid discovery of new genes."; RL Genome Res. 10:1617-1630(2000). RN [7] RP NUCLEOTIDE SEQUENCE. RC STRAIN=C57BL/6J; TISSUE=Bone marrow; RX MEDLINE=20530913; PubMed=11076861; DOI=10.1101/gr.152600; RA Shibata K., Itoh M., Aizawa K., Nagaoka S., Sasaki N., Carninci P., RA Konno H., Akiyama J., Nishi K., Kitsunai T., Tashiro H., Itoh M., RA Sumi N., Ishii Y., Nakamura S., Hazama M., Nishine T., Harada A., RA Yamamoto R., Matsumoto H., Sakaguchi S., Ikegami T., Kashiwagi K., RA Fujiwake S., Inoue K., Togawa Y., Izawa M., Ohara E., Watahiki M., RA Yoneda Y., Ishikawa T., Ozawa K., Tanaka T., Matsuura S., Kawai J., RA Okazaki Y., Muramatsu M., Inoue Y., Kira A., Hayashizaki Y.; RT "RIKEN integrated sequence analysis (RISA) system--384-format RT sequencing pipeline with 384 multicapillary sequencer."; RL Genome Res. 10:1757-1771(2000). RN [8] RP NUCLEOTIDE SEQUENCE. RC STRAIN=C57BL/6J; TISSUE=Bone marrow; RA Arakawa T., Carninci P., Fukuda S., Hashizume W., Hayashida K., RA Hori F., Iida J., Imamura K., Imotani K., Itoh M., Kanagawa S., RA Kawai J., Kojima M., Konno H., Murata M., Nakamura M., Ninomiya N., RA Nishiyori H., Nomura K., Ohno M., Sakazume N., Sano H., Sasaki D., RA Shibata K., Shiraki T., Tagami M., Tagami Y., Waki K., Watahiki A., RA Muramatsu M., Hayashizaki Y.; RL Submitted (MAR-2004) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. CC -!- SIMILARITY: Belongs to the peptidase C1 family. CC --------------------------------------------------------------------------- CC Copyrighted by the UniProt Consortium, see https://www.uniprot.org/terms CC Distributed under the Creative Commons Attribution (CC BY 4.0) License CC --------------------------------------------------------------------------- DR EMBL; AK152192; BAE31022.1; -; mRNA. DR UniGene; Mm.322945; -. DR IPI; IPI00130015; -. DR Ensembl; ENSMUSG00000030560; Mus musculus. DR MGI; MGI:109553; Ctsc. DR HOVERGEN; Q3U8J6; -. DR ArrayExpress; Q3U8J6; -. DR Bgee; Q3U8J6; -. DR GO; GO:0004197; F:cysteine-type endopeptidase activity; IEA:InterPro. DR GO; GO:0006508; P:proteolysis; IEA:InterPro. DR InterPro; IPR000169; Pept_cys_AS. DR InterPro; IPR013128; Peptidase_C1A. DR InterPro; IPR000668; Peptidase_C1A_C. DR PANTHER; PTHR12411; Peptidase_C1A; 1. DR Pfam; PF00112; Peptidase_C1; 1. DR ProDom; PD000158; Peptidase_C1; 1. DR SMART; SM00645; Pept_C1; 1. DR PROSITE; PS00640; THIOL_PROTEASE_ASN; 1. DR PROSITE; PS00639; THIOL_PROTEASE_HIS; 1. PE 2: Evidence at transcript level; FT NON_TER 1 1 SQ SEQUENCE 191 AA; 21284 MW; DD23973C2C7982A1 CRC64; ILTNNSQTPI LSPQEVVSCS PYAQGCDGGF PYLIAGKYAQ DFGVVEESCF PYTAKDSPCK PRENCLRYYS SDYYYVGGFY GGCNEALMEL ELVKHGPMAV AFEVHDDFLH YHSGIYHHTG LSDPFNPFEL TNHAVLLVGY GRDPVTGIEY WIIKNSWGSN WGESGYFRIR RGTDECAIES IAVAAIPIPK L //