##gff-version 3 Q9H1Y0 UniProtKB Chain 1 275 . . . ID=PRO_0000218994;Note=Autophagy protein 5 Q9H1Y0 UniProtKB Modified residue 1 1 . . . Note=N-acetylmethionine;Ontology_term=ECO:0007744;evidence=ECO:0007744|PubMed:22814378;Dbxref=PMID:22814378 Q9H1Y0 UniProtKB Cross-link 130 130 . . . Note=Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ATG12);Ontology_term=ECO:0000305;evidence=ECO:0000305 Q9H1Y0 UniProtKB Alternative sequence 1 79 . . . ID=VSP_003791;Note=In isoform Short. MTDDKDVLRDVWFGRIPTCFTLYQDEITEREAEPYYLLLPRVSYLTLVTDKVKKHFQKVMRQEDISEIWFEYEGTPLKW->M;Ontology_term=ECO:0000303,ECO:0000303;evidence=ECO:0000303|PubMed:17974005,ECO:0000303|Ref.2;Dbxref=PMID:17974005 Q9H1Y0 UniProtKB Natural variant 58 58 . . . ID=VAR_036243;Note=In a colorectal cancer sample%3B somatic mutation. K->M;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:16959974;Dbxref=PMID:16959974 Q9H1Y0 UniProtKB Natural variant 122 122 . . . ID=VAR_079274;Note=In SCAR25%3B reduced conjugation to ATG12%3B decrease in autophagy activity. E->D;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:26812546;Dbxref=dbSNP:rs1131692265,PMID:26812546 Q9H1Y0 UniProtKB Mutagenesis 130 130 . . . Note=Loss of conjugaction with ATG12. Does affect interaction with DHX58%2C nor with MAVS. K->R;Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:17709747,ECO:0000269|PubMed:9852036;Dbxref=PMID:17709747,PMID:9852036 Q9H1Y0 UniProtKB Helix 4 12 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4TQ1 Q9H1Y0 UniProtKB Beta strand 15 22 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4TQ1 Q9H1Y0 UniProtKB Helix 23 27 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:7W36 Q9H1Y0 UniProtKB Beta strand 28 30 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4GDL Q9H1Y0 UniProtKB Helix 31 34 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4NAW Q9H1Y0 UniProtKB Beta strand 35 40 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4TQ1 Q9H1Y0 UniProtKB Helix 45 48 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4TQ1 Q9H1Y0 UniProtKB Helix 50 57 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4TQ1 Q9H1Y0 UniProtKB Helix 62 64 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4NAW Q9H1Y0 UniProtKB Beta strand 69 72 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4TQ1 Q9H1Y0 UniProtKB Helix 83 91 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4TQ1 Q9H1Y0 UniProtKB Beta strand 92 94 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:5D7G Q9H1Y0 UniProtKB Beta strand 96 103 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4TQ1 Q9H1Y0 UniProtKB Turn 109 111 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4TQ1 Q9H1Y0 UniProtKB Helix 113 116 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:7W36 Q9H1Y0 UniProtKB Helix 118 137 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4TQ1 Q9H1Y0 UniProtKB Helix 140 144 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4TQ1 Q9H1Y0 UniProtKB Helix 147 158 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4TQ1 Q9H1Y0 UniProtKB Helix 162 172 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4TQ1 Q9H1Y0 UniProtKB Helix 177 179 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4TQ0 Q9H1Y0 UniProtKB Beta strand 187 192 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4TQ1 Q9H1Y0 UniProtKB Beta strand 194 196 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4TQ1 Q9H1Y0 UniProtKB Beta strand 208 210 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4GDL Q9H1Y0 UniProtKB Helix 215 222 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4TQ1 Q9H1Y0 UniProtKB Helix 224 226 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4TQ1 Q9H1Y0 UniProtKB Turn 229 231 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4TQ1 Q9H1Y0 UniProtKB Beta strand 232 240 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4TQ1 Q9H1Y0 UniProtKB Helix 251 257 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4TQ1 Q9H1Y0 UniProtKB Beta strand 265 270 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:4TQ1